TY - JOUR AU - Денис Борисович Тихонов AU - Борис Соломонович Жоров PY - 2019/08/24 Y2 - 2024/03/29 TI - МЕТОДЫ МОЛЕКУЛЯРНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ В ИЗУЧЕНИИ СТРОЕНИЯ ИОННЫХ КАНАЛОВ И ИХ МОДУЛЯЦИИ ЛИГАНДАМИ JF - Российский физиологический журнал им. И. М. Сеченова JA - Рос. физиол. журн. им. И. М. Сеченова VL - 105 IS - 11 SE - Обзорные и проблемные статьи DO - 10.1134/S0869813919110116 UR - https://rusjphysiol.org/index.php/rusjphysiol/article/view/555 AB - Ионные каналы представляют собой разнообразное семейство трансмембранных белков, которые регулируют поток ионов через клеточные мембраны. Они вовлечены в многочисленные физиологические процессы и являются мишенями для разнообразных природных токсинов и фармакологических препаратов. Однако молекулярные детали структур каналов, механизмы их работы и взаимодействия с лигандами все еще обсуждаются. Одной из причин этого является нехватка трехмерных структур атомарного разрешения. В течение последних двух десятилетий значительный вклад в эту область внесли косвенные экспериментальные подходы, включая мутагенез, электрофизиологию и анализ структурно-функциональных связей в рядах лигандов. Молекулярное моделирование широко применялось для структурной интерпретации этих экспериментальных данных. Последние достижения рентгеновской кристаллографии и криоэлектронной микроскопии дают однозначные решения многих структурных проблем, которые ранее решались только косвенными и модельными исследованиями. В этом обзоре описывается несколько примеров структурных предсказаний, которые были сделаны с помощью молекулярного моделирования с целью объяснения косвенных экспериментальных данных. Мы сравниваем модели с недавно опубликованными экспериментальными структурами. Хорошее согласие многих предсказаний с более поздними опубликованными экспериментальными структурами подтверждает перспективы дальнейшего использования молекулярных модельных исследований. Имеющиеся в настоящее время и ожидаемые структуры основных ионных каналов и их комплексов с лигандами обеспечивают реалистичные шаблоны для моделирования каналов, их множественных вариантов, в том числе связанных с каналопатиями, и для предсказания связывания фармакологических препаратов и токсинов. Эти исследования, как ожидается, обеспечат высококачественные прогнозы, которые необходимы для разработки новых специфичных для канала лигандов и рекомендаций по персонализированной терапии. ER -